Bệnh hô hấp trên heo thường có tính chất đa yếu tố, do nhiều nguyên nhân và mầm bệnh kết hợp gây nên như vi sinh vật (virus, vi khuẩn); môi trường (tiểu khí hậu chuồng nuôi) và quy trình quản lý đàn, ... Bởi tính phức tạp của nó nên vấn đề kiểm soát bệnh cũng cần phải kết hợp nhiều yếu tố. Chung quy lại để kiểm soát tốt bệnh hô hấp cần tuân thủ thực hành theo quy tắc 03 tốt và 03 đúng dưới đây:
Bệnh lý hô hấp trên heo liên quan đến nhiều tác nhân vi sinh vật như M. hyopneumonia, H. parasuis, P. multocida, B. bronchiseptica, A. pleuropneumoniae, Streptococcus, PRRSV, PCV2, virus cúm…. Để đạt được hiệu quả phòng chống bệnh hô hấp cần thực hiện tốt quy trình miễn dịch trên đàn nái, miễn dịch ở heo con theo mẹ, miễn dịch ở heo sau cai sữa, với độ phủ miễn dịch rộng. Để làm điều này trại nên tiêm vaccine phòng các loài vi sinh vật M. hyopneumonia, H. parasuis, P. multocida, B. bronchiseptica, A. pleuropneumoniae, Streptococcus, PRRSV, PCV2, virus cúm…. trên đàn nái và đàn heo sau cai sữa, kiểm soát tối đa sự xâm nhiễm và lây truyền các tác nhân vi sinh vật gây bệnh hô hấp phức hợp trên đàn heo. Để chương trình vaccine có thể đạt được hiệu quả trại cần thực hiện việc tầm soát xác định nguyên nhân gây bệnh lý hô hấp phức hợp ở heo tại trại, đánh giá mức độ nguy cơ của từng tác nhân gây bệnh lý hô hấp khác ở heo. Quản lý tình trạng sạch PRRSV trên đàn nái, sự lây truyền virus từ mẹ sang con và nâng cao miễn dịch ở đàn nái, hậu bị và heo con theo mẹ là các biện pháp chính trong kiểm soát PRRSV. Giữ sạch đàn đối với PRRSV là giải pháp tối ưu cho đàn sinh sản, và tiêm phòng vaccine cho đàn heo thương phẩm sẽ là giải pháp an toàn và hiệu quả kinh tế.
Ngoài ra việc kiểm soát an toàn sinh học và quản lý đàn tốt cũng là những yếu tố vô cùng quan trọng: quản lý cùng vào cùng ra, vệ sinh tiêu độc, định kỳ đánh giá tình trạng của trại kết hợp quy trình chăm sóc tốt nái mang thai, nuôi con, cai sữa, ghép bầy và mật độ đàn hợp lý.
Với sự đa dạng và đồng nhiễm nhiều loài vi khuẩn gây bệnh trong bệnh lý hô hấp phức hợp ở heo, việc thực hành tốt 03 quy tắc đúng đóng vai trò then chốt: đúng tác nhân, đúng thời điểm và đúng quy trình. Tiêm vắc-xin phòng các tác nhân gây bệnh trên đường hô hấp là biện pháp quan trọng và hiệu quả trong kiểm soát bệnh lý hô hấp ở heo. Tuy nhiên, trong trường hợp áp lực dịch bệnh cao, các giải pháp chăn nuôi chưa được thực hiện tốt, đồng bộ… bổ sung kháng sinh vào trong thức ăn hoặc nước uống cho heo là giải pháp cần thiết giúp tăng cường hiệu quả kiểm soát bệnh lý hô hấp ở heo sau cai sữa. Ví dụ kháng sinh được sử dụng trong phòng – trị bệnh hô hấp phải là các kháng sinh phổ rộng như nhóm macrolid (Tulathromycin - Tulisin 100) hoặc kết hợp kháng sinh như: tetracyclines, pleuromutilins, lincosamides valnemulin + chlortetracycline, tiamulin + chlortetracycline, tilmicosin, chlortetracycline + procaine penicillin + sulfadimidine và lincomycin + chlortetracycline... Liệu trình phòng trị thường phải kéo dài 2 – 3 tuần mới có thể phát huy hiệu quả.
Tóm lại, để kiểm soát tốt bệnh hô hấp phức hợp trên heo cần phải thực hiện bao gồm nhiều nhóm giải pháp kết hợp với nhau: sử dụng kháng sinh, tiêm vaccine, an toàn sinh học. Các biện pháp quản lý kiểm soát lây nhiễm, đóng đàn, cai sữa sớm, cùng vào cùng ra, tầm soát nhiễm… phải được thực hiện đồng bộ.